Разбиране на генетичния доклад на вашето дете
Когато за първи път получите генетичен доклад за детето си, може да се почувствате, че е написан на съвсем различен език.
Дълги думи. Струни от букви и цифри. Таблици, пълни с кодове, които изглеждат невъзможни за разбиране.
Много родители ни казват едно и също:
"Имаме доклада... но всъщност не разбираме какво означава той."
Ако това ви звучи познато, не сте сами.
Това ръководство е тук, за да ви помогне да разберете ключовите части на генетичния доклад, така че можете да се почувствате малко по-уверени, като го прочетете —, без да е необходимо да ставате учен.
Целта не е да се декодира всяко число или технически детайл. Вместо това искаме да ви помогнем да разпознаете основните части от информацията, да разберете вида генетична промяна, която вашето дете има в NARS1 ген, и да знаете къде да намерите допълнителна поддръжка.
Кратко обобщение: ДНК, гени и хромозоми
ДНК
ДНК е дългият химически код, който носи всички инструкции за това как тялото расте и работи. ДНК е проста азбука от само четири букви: A, C, T и G.
Гените
ДНК се разделя на специфични секции, наречени гени. Те са като отделни рецепти, написани по ДНК. Всеки ген казва на тялото как да направи специфичен протеин, който изпълнява важна работа.
The NARS1 ген предоставя инструкции за производството на протеина NARS1, който помага на клетките да изградят други протеини, от които тялото се нуждае.
Хромозоми
Хромозомите са като книги, направени от ДНК, които съдържат много гени. Хората обикновено имат цялата си ДНК разделена на 46 хромозоми, подредени в 23 чифта. Всеки родител допринася с един набор от хромозоми (23) към 46-те хромозоми на детето.
Повечето гени влизат две копия
Ако едно или и двете копия на ген съдържат важна промяна (наречена a вариант), това може да повлияе на работата на този ген и понякога да доведе до здравословно състояние.
Какво всъщност ви казва генетичният доклад
Въпреки че генетичните доклади могат да изглеждат сложни, те обикновено отговарят на три основни въпроса:
Кой ген участва и къде
Какъв вид промяна (вариант) е била намерена
Какво в момента учените вярват, че промяната означава
Вашият отчет обикновено включва таблица, описваща идентифицирания вариант или варианти.
За много семейства NARS1 има два варианта, по един наследен от всеки родител. В други случаи може да се появи вариант de novo, което означава, че се е случило спонтанно при оплождането на детето/около яйцеклетката.
Защо някои доклади показват един вариант, а други два
Има два основни начина, по които вариантите на NARS1 могат да се появят в отчетите.
De novo варианти
Понякога се появява вариант ново в ДНК-то на детето, въпреки че нито един от родителите не го носи в своите соматични клетки (които не участват в размножаването).
Това се нарича а de novo вариант.
В тези случаи докладът може само да показва един вариант.
Наследени варианти
Ако и двамата родители носят променено копие на гена, детето може да наследи два варианта.
Понякога това са:
Един и същ вариант и в двете копия на гена (наречен автозомно рецесивен или хомозиготен)
Два различни варианта (наречен съединение хетерозиготно)
В тези случаи докладът обикновено ще покаже два реда или две таблици, по един за всеки вариант.
Разделът с варианти може да изглежда различно в различните отчети
Всеки лабораторен формат отчита малко по-различно.
Някои отчети показват информацията в таблици. Други описват вариантите в параграфи или точки.
Разделът, описващ варианта, може също да се появи под различни заглавия в зависимост от лабораторията или държавата.
Повечето доклади включват подробности като:
на генно име
на описание на варианта
на класификация
на зиготност
на наследяване
понякога геномни координати
Може да видите заглавия като:
Вариант
Вариантни детайли
Вариант на последователността
Молекулярно намиране
Генетични находки
Вариантна интерпретация
Открит вариант
Въпреки че формулировката може да варира, предоставената информация обикновено е много сходна.
Ако не сте сигурни за какво се отнася даден раздел, потърсете име на ген (например NARS1) и на описание на варианта често е най-лесният начин да се ориентирате.
Примерен вариант от отчет
Докладът може да включва таблица, която изглежда по следния начин:
На пръв поглед това изглежда сложно, но всяка част просто описва различен аспект на варианта.
Нека го разбием.
Разбиране на описанието на варианта на тежкотоварни автомобили
Описанието на варианта следва международни правила, наречени Номенклатура на тежкотоварните автомобили.
Въпреки че изглежда технически, обикновено съдържа две ключови части:
а Промяна на нивото на ДНК
а промяна на нивото на протеина
Пример:
NARS1 c.268C>T стр.(Arg90Ter)
Промяната на нивото на протеина
Частта, започваща с п. описва какво се случва с протеина, който генът обикновено произвежда.
Протеините са направени от градивни елементи, наречени аминокиселини, които са написани с помощта на трибуквени кодове.
Пример:
п.(Arg90Ter)
Това означава:
Arg
аргинин, аминокиселината, която трябваше да бъде на тази позиция 90
позицията в протеина Тер
стоп сигнал
Така че това ни казва:
"На позиция 90 аргининът е променен в стоп сигнал."
Този тип промяна се нарича a глупости или вариант стоп-усилване.
Тъй като инструкциите спират рано, протеинът може да е непълен и да не може да функционира правилно.
Понякога стоп сигналът се записва като:
Тер
*
X
Всички те означават едно и също нещо.
Промяната на нивото на ДНК
Частта, започваща с c. описва промяната в ДНК последователността на гена.
Пример:
c.268C>T
Това може да се раздели на:
c.
това ни казва, че разглеждаме кодиращата ДНК последователност 268
позицията в гена, където настъпва промяната C>T
ДНК буквата C е заменена с T
Така че това означава:
"На позиция 268 в гена NARS1 буквата С е заменена с Т."
Може да видите и други окончания на ниво ДНК като:
дел
изтриване (буквите са премахнати) инс
вмъкване (добавени букви) dup
дублиране (буквите са копирани) делинс
буквите са изтрити и заменени с различни
Например:
c.250_253del
Това означава, че буквите на позиции 250–253 са изтрити.
Други промени в протеините, които може да видите
Вариант на изместване на рамката
Пример:
p.Lys84Serfs*12
Това означава:
лизинът на позиция 84 става серин
рамката за четене на протеина се измества
стоп сигнал се появява 12 аминокиселини по-късно
Изместването на рамката е малко като премахване на буква в средата на изречение, всичко след тази точка се чете неправилно.
За протеините това обикновено води до съкратен и нефункционален протеин.
Мисенс вариант
Пример:
p.Arg412Gly
Това означава, че аргининът е заменен с глицин на позиция 412.
Изтриване
Пример:
p.Lys84del
Това означава, че аминокиселината лизин в позиция 84 е отстранена.
Как да разчетем вашия вариант
Сега, когато имате цялата тази информация, как я използвате, за да прочетете и разберете вашия вариант?
Тази диаграма подчертава ключовите части от описанието на варианта, така че можете бързо да видите какво означава всяка част.
Пример:
NARS1 c.268C>T стр.(Arg90Ter)
NARS1
участващият ген c.268C>T
промяната на нивото на ДНК п.(Arg90Ter)
промяната на нивото на протеина
Разбиране на другите елементи във вашия доклад
Зиготност: колко копия са засегнати
Докладът също така ще опише колко копия на гена съдържат варианта.
Общите термини включват:
Хетерозиготен
Едното копие на гена има варианта, а другото не.
Хомозиготен
И двете копия на гена съдържат един и същ вариант.
Съединение хетерозиготно
Всяко копие на гена съдържа различен вариант.
Много деца с разстройство NARS1 са съставни хетерозиготни: два хетерозиготни варианта — по един във всяко копие на гена.
Наследство: откъде идват вариантите
Докладът може също да посочи откъде идват вариантите. Това изисква родителската ДНК да бъде секвенирана заедно с тази на детето.
Например:
Майчински
наследено от майката Бащински
наследено от бащата De novo
ново при детето и не присъства в нито един от родителите в соматичните клетки
Както наследените, така и de novo вариантите се наблюдават в семействата NARS1.
Класификация: какво смятат учените за варианта
Генетичните лаборатории също възлагат a класификация, което отразява текущото им разбиране за варианта.
Общите категории включват:
Патогенен - Причиняващи заболяване.
Вероятни патогенни - Много вероятно причиняващи заболяване.
Вариант на несигурно значение (VUS) - Учените все още не знаят дали вариантът причинява заболяване.
Вероятно доброкачествен / доброкачествен - Малко вероятно е да причини заболяване.
Защото Разстройството на NARS1 е изключително рядко и все още се проучва, несигурните класификации са доста често срещани.
Това може да се почувства обезпокоително, но просто отразява, че науката все още се учи.
Тъй като се идентифицират повече семейства и се правят повече изследвания, някои варианти може да са прекласифицирани във времето.
Това е една от причините фондация Rory Belle да работи в тясно сътрудничество със семейства и изследователи по целия свят — споделянето на информация помага за подобряване на разбирането на NARS1.
Геномни координати: GPS местоположението на генома
Някои доклади включват и нещо, наречено геномни координати, което може да изглежда така:
Chr18 (GRCh38):g.57615715G>A
Това описва точно същата генетична промяна, но използвайки пълната карта на човешкия геном.
Разбиване:
Chr18
вариантът се намира на хромозома 18 GRCh38
версията на човешкия референтен геном, използвана от лабораторията. g.57615715G>A
на позиция 57,615,715 на тази хромозома, ДНК буквата G се промени на A
Можете да мислите за това като за GPS координати на варианта в човешкия геном.
Учените и лабораториите използват тази информация, за да се уверят, че обсъждат точно същата генетична промяна при споделяне на данни и изследвания.
Родителите обикновено не трябва да използват тази линия в ежедневието, но тя може да се появи в докладите, така че е полезно да я разпознаете.
Не е нужно да разбирате всичко
Генетичните доклади са сложни, дори за професионалисти.
Напълно нормално е родителите да се чувстват претоварени, когато ги четат за първи път.
Разбиране само на няколко ключови части от информацията, като например генно име, the описание на варианта, и на класификация, вече може да направи един доклад да се чувства много по-управляем.
Ако искате да научите повече за самото разстройство NARS1, можете да прочетете нашето ръководство:
Тук сме, за да помогнем
Ако не сте сигурни какво означава докладът на детето ви, моля, не забравяйте, че не сте сами.
Фондация Rory Belle е тук, за да подкрепя семействата на всеки етап — от диагнозата до разбирането на науката зад NARS1.
Понякога първата стъпка е просто някой да помогне да обясни доклада на ясен език.
Моля свържете се ако ти трябва подкрепа
Последна дума - Как генетичният доклад на вашето дете може да подпомогне изследванията
Когато започнете да разбирате генетичния доклад на детето си, може да чуете и за ролята му в изследванията.
Участието в изследвания винаги е личен избор, но за семействата, които искат да се включат, генетичният доклад може да играе важна роля.
Докладът на вашето дете помага на изследователите:
Разберете точно кой вариант има вашето дете
Това позволява на изследователските екипи да проектират проучвания, тестове и потенциални терапии, съобразени със специфични генетични промени, без семействата да трябва да запомнят сложни варианти на детайли.Включете детето си в изследователски платформи и изследвания по естествена история
Тези проучвания помагат да се изгради по-ясна картина за това как NARS1 засяга децата с течение на времето, което е от съществено значение за разработването на бъдещи лечения.По-добре разберете моделите на наследяване
Когато вариантите се наследяват, тази информация може да помогне на изследователите да използват родителски проби като сравнения в лабораторията, укрепвайки качеството на изследванията.
С течение на времето това споделено знание помага за придвижването на изследванията напред, доближавайки ни до по-доброто разбиране на NARS1 и разработването на бъдещи лечения.
Ако искате да научите повече за това как да се включите, можете да посетите нашия - Страница Изследвания по естествена история
Никога няма натиск за участие, но ако се интересувате, фондация Рори Бел може да ви преведе през опциите.